Katharina Heutjer studierte Barockvioline an der Schola Cantorum Basiliensis bei Chiara Banchini, wo sie das Solodiplom mit Auszeichnung erlangte. Sie erhielt künstlerische Anregungen von verschiedenen renommierten Musikern und gewann zahlreiche erste Preise bei nationalen und internationalen Wettbewerben, darunter den Deutschen Tonkünstlerwettbewerb, den Charles Hennen Concours, Niederlande sowie Musica Antiqua Brügge, Belgien. 2009 wurde ihr der Europäische Kulturförderpreis verliehen.
Katharina Heutjer ist eine aktive Konzertmusikerin und Konzertmeisterin, die weltweit auftritt, jedoch besonders gerne in Basel, wo sie mit ihrer Familie lebt. Sie spielt mit Ensembles wie Cantus Cölln, Collegium Vocale Gent, Ensemble La Fenice, Weser Renaissance, Musica Fiorita, Le poème harmonique, Les Agrémens, Les cornets noirs, Collegium 1704 und unter Dirigenten wie Konrad Junghänel, Philippe Herreweghe und Andrea Marcon. Seit 2008 spielt sie als Konzertmeisterin bei La Cetra Basel.
Von einer Mäzenin erhielt sie 2017 eine Barockvioline von Sebastian Klotz, Mittenwald 1760, die sie abwechselnd mit ihrer Violine von Daniel Frisch spielt.
